日喀则地区的矿产资源丰富，开发利用前景光明。根据普查，全地区18个县市，共发现矿床、矿（化）点及找矿线索234处，有金、银、锌、铅、锂、锑、汞、铜、铁、锰、铯、铬、硼、云母、砷、食盐、芒硝、钾、水晶、硫、磷、明矾石、煤、泥炭、油页岩、菱镁石、瓷土、石膏、石墨、石灰石、仁布玉石等46种，其中硼砂储量较大。另外，谢通门县、拉孜县的金矿，日喀则市、仁布县的、白朗县的的铬铁矿等都极具开采价值。目前只有煤、硼砂、玉石、食盐、石灰石、大理石等被少量开采。日喀则地区的能源资源也极为丰富，除地热能、太阳能、风能外，尤以水能资源潜力巨大。据初步估计，仅雅鲁藏布江、年楚河的年径流量270亿立方米，天然水能蕴藏量1000余万千瓦。
　　后藏是西藏传统的农区，种植业具有悠久的历史，作物品种繁多。在河谷、湖滨地带和气候适宜的小气候区，广泛分布着各种类型的的作物种类。主要农作物有青稞、春小麦、冬小麦、油菜、豆类等，尤以青稞种植面积最大。在吉隆、定日、亚东等喜马拉雅沟谷中，还出产玉米、谷子、荞麦等农作物。主要蔬菜品种有白菜、萝卜、莲花白、莴笋、菠菜、芹菜、韭菜、辣椒、西红柿、黄瓜、大蒜等几十种。部分地区还出产苹果、核桃等果品。当地群众还非常喜欢种植花卉，常见的有吊金钟、卓玛花、格桑花、月季、玫瑰、海棠等几十个品种。
　　日喀则地区的动物资源也十分丰富。主要家畜有牦牛、黄牛、犏牛、马、驴、山羊、绵羊、猪、鸡等。野生动物有生活在喜马拉雅山南坡亚热带、温带丛林中的小熊猫、长尾叶猴、野牛、棕熊、黑熊、金钱豹、猕猴、野猪、河鹿、野猫等几十种。生活在雪线附近有雪豹、岩羊。在喜马拉雅山以北的高原上有野牦牛、野驴、岩羊、羚羊、黄羊、盘羊、狐狸、野兔、獐子、野狼、猞猁、旱獭等近百种。鸟类资源中有马鸡、藏雪鸡、秃鹫、黑颈鹤、血雉、鱼鸥、野鸭、斑头雁、红嘴鸥、棕头鸟、赤嘴鸟、太阳鸟、山雀、野鸽、斑鸠、麻雀等200余种。其中野牦牛、野驴、藏羚羊、岩羊、雪豹、黑颈鹤属国家一类保护动物。